Lançado em março de 1999, o objetivo do Programa de Pesquisas em Caracterização, Conservação, Restauração e Uso Sustentável da Biodiversidade (Biota-FAPESP) é conhecer, mapear e analisar a biodiversidade do Estado de São Paulo.
O Programa de Pesquisa Ecológica de Longa Duração (PELD), criado em 1999, é uma iniciativa pioneira e uma visão estratégica do Governo Federal para articulação de uma rede de sítios de referência para a pesquisa científica no tema de Ecologia de Ecossistemas.
O Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade foi criado em 28 de agosto de 2007, pela Lei 11.516, o ICMBio é vinculado ao Ministério do Meio Ambiente e integra o Sistema Nacional do Meio Ambiente (Sisnama).